2007年，连云港市口岸信息化领导小组召开组建连云港电子口岸建设和运营实体专题会议，组建连云港电子口岸信息发展有限公司；2014年，公司完成国有企业“混改”，公司员工持有公司15%的股份；2017年，连云港港口集团有限公司将其负责港内信息化建设的全资子公司连云港通信信息工程公司与公司合并，从而实现了港内与口岸信息化建设力量的联合。